В дикой, оригинальной среде, помидоры оплодотворяются при помощи перекрестного опыления. Они менее склонны к самоопылению, в отличие от домашних сортов. Чтобы избежать самоопыления пестики диких помидоров выходят из цветка дальше, чем, у окультуренных сортов. Тычинки представляют собой единое целое у обоих видов томатов.

     Когда помидоры переместились из своих родных регионов, их традиционные опылители (возможно, некоторые виды пчел) не изменили места «проживания» вместе с ними. В этом случае механизм самоопыления (самооплодотворение) стал преимущественным для растений, и домашние сорта подверглись селекции, чтобы усилить этот механизм.

     Но то, что происходит у томатов, не может быть названо самоопылением в том смысле, как мы привыкли его понимать, хотя автоматически этот процесс называется одинаково. Помидоры слабо самоопыляются без посторонней помощи. Яркий тому пример можно увидеть в теплицах, где для опыления используется искусственный ветер, покачивание растений (существует даже такое приспособление – «электрическая пчела», предназначенное для ручного покачивания стебля), или, что намного проще и дешевле, прирученными шмелями.

     Пыльник цветка помидора представляет собой полую трубку, где пыльца производится внутри, а не на поверхности, как у многих видов растений. Пыльца движется сквозь поры в пыльниковый мешок, но реально просочиться может только очень небольшое количество, если не будет никакого влияния с внешней стороны.

     Лучшим источником внешнего движения является, конечно же, пчела, которая издает ультразвук, как например шмель или оригинальная дикая пчела-халисид. При условиях выращивания на свежем воздухе в роли средств движения выступают ветер и механическое движение, которого в природных условиях не избежать.

     Помидоры обычно выращиваются в теплицах, если регион отличается более прохладным климатом. Таковыми являются британский «Манимэйкер» и большое количество сортов, выращиваемых в Сибири. Они специально выращиваются для культивации в тепличном хозяйстве. В регионах с более умеренным климатом, общепринятой практикой является подготовка семян к будущей посадке в теплицу уже в конце зимы. Наряду с пересаживанием томатов, существует также процесс закаливания, который необходим для растения, прежде чем его высадят в грунт. Закаливание повышает жизнеспособность вида.

     Опыление томатов при помощи гидропоники также имеет место в промышленном разведении. Эта техника используется, как правило, на насаждениях с высокой плотностью посадки.